La ressource hydrique principale de l’Aquarium est la mer Tyrrhénienne ; en effet notre établissement est doué d’une prise qui pompe l’eau de la mer directement de la plage située en face du bâtiment grâce à un système de tuyaux, qui la soulèvent et la filtrent mécaniquement. Ce système d’approvisionnement nous offre une qualité excellente de l’eau et nous permet d’élever des espèces délicates comme les crustacés des abysses et les gorgonies. Toutefois, ce système de gestion de l’eau n’a pas une approche antiéconomique : on change l’eau partiellement une fois par mois selon les exigences de chaque bassin, pour éviter d’altérer les paramètres chimiques et physiques.