Tutti gli organismi presenti presso l'Acquario di Cala Gonone, prima di essere trasferiti nelle vasche espositive, sono sottoposti ad un periodo di quarantena nelle vasche di una sezione non aperta al pubblico denominata stabulario.
In questa area, completamente isolata dal resto dell'Acquario e dotata di tutta la tecnologia (sistema di regolazione della temperatura, impianto di filtrazione meccanica, schiumatoio di proteine, debatterizzatore a raggi ultravioletti, linea di acqua salata e dolce, sensori di livello e di temperatura collegati con una centrale di allarme attiva h24) per garantire una ottima qualità dell'acqua, gli animali vengono tenuti sotto osservazione per verificare il loro stato di salute e procedere, se necessario, alle cure del caso.